Grippe aviaire aux États-Unis : l'activité du virus H5N1 repart à la hausse alors que la migration automnale commence

La grippe aviaire A(H5N1) hautement pathogène refait surface chez les volailles aux États-Unis à mesure que la saison migratoire d'automne s'installe. Au cours des dix derniers jours, l'Iowa a confirmé un nouveau foyer de H5N1 dans un élevage de basse-cour, tandis que la surveillance menée par l'USDA continue de mettre en évidence la recrudescence des infections chez les volailles, observée depuis septembre, en particulier dans le nord des États-Unis.

Le dernier cas confirmé a été signalé le 22 septembre dans le comté de Boone, dans l’Iowa, où le virus H5N1 a été détecté au sein d’un élevage de basse-cour regroupant plusieurs espèces. Selon les autorités de l’État, ce troupeau comptait 138 oiseaux. Il s’agissait de la septième détection du virus H5N1 dans l’Iowa en 2026, mais il est important de noter qu’aucun des foyers signalés cette année dans l’État n’a concerné un élevage avicole commercial. L’Iowa n’avait pas signalé de cas de H5N1 chez des volailles domestiques depuis mars, ce qui fait de cette détection de septembre un signe supplémentaire que la situation épidémiologique évolue à mesure que les oiseaux migrateurs se dirigent vers le sud.

L’APHIS (Service de protection des végétaux et des animaux) de l’USDA souligne explicitement que les cas détectés chez la volaille ont tendance à augmenter pendant les migrations d’automne et de printemps, lorsque des oiseaux sauvages infectés peuvent introduire le virus dans de nouvelles zones et contaminer l’environnement autour des élevages de volaille.

Les infections dans les élevages avicoles commerciaux ont refait surface en septembre

Le foyer observé dans un élevage de basse-cour de l’Iowa fait suite à une résurgence plus large qui a débuté plus tôt dans le mois. Après plusieurs mois d’été relativement calmes, le virus H5N1 a refait son apparition dans les élevages commerciaux de dindes du Minnesota, du Dakota du Nord, du Dakota du Sud et de l’Idaho. À la mi-septembre, sept cas avaient déjà été signalés dans des élevages commerciaux depuis le début du mois, avec environ 360 000 oiseaux touchés, tous élevages commerciaux et de basse-cour confondus, au cours des 30 jours précédents.

Parmi les foyers les plus importants figuraient des élevages commerciaux de dindes impliquant environ 61 300 oiseaux dans le comté de McPherson (Dakota du Sud) ; 43 800 dans le comté de Turner (Dakota du Sud) ; 41 600 oiseaux dans le comté de LaMoure (Dakota du Nord) ; et 29 800 dindes dans le comté de Wright (Minnesota).

Le foyer du comté de Wright, dans le Minnesota, confirmé le 1er septembre, était la première détection de grippe aviaire hautement pathogène (HPAI) chez la volaille dans cet État depuis le 20 mai. Les autorités vétérinaires avaient déjà averti que la combinaison de la migration automnale et de conditions météorologiques exceptionnellement humides pourrait accroître les contacts entre les oiseaux aquatiques sauvages et les élevages de volaille.

Les oiseaux sauvages restent le principal indicateur épidémiologique

Cette recrudescence des cas chez les volailles coïncide avec la poursuite des détections du virus H5 chez les oiseaux sauvages. Le système de surveillance des oiseaux sauvages de l’USDA a enregistré en septembre plusieurs détections du virus H5 de lignée eurasienne dans le Minnesota, notamment chez des bernaches du Canada, des canards colverts, des grands-ducs d’Amérique et des pygargues à tête blanche. Les échantillons prélevés fin août et début septembre ont été confirmés positifs le 16 septembre.

L’APHIS décrit la surveillance des oiseaux sauvages comme un système d’alerte précoce, car les oiseaux migrateurs infectés peuvent introduire le virus dans des zones où la volaille d’élevage et de basse-cour est vulnérable. Ce lien ne signifie pas pour autant que chaque foyer de contamination chez la volaille résulte directement d’un contact avec un oiseau sauvage infecté. Le virus peut également atteindre les exploitations de manière indirecte par le biais d’eau, de matériel, de vêtements, de véhicules contaminés ou d’autres voies environnementales. Toutefois, le retour saisonnier des cas détectés chez les oiseaux sauvages accroît la pression sur la biosécurité avicole.

Plus de 208 millions de volailles touchées aux États-Unis depuis 2022

L’activité actuelle de cet automne reste bien en deçà des plus grandes vagues de l’épizootie H5N1 aux États-Unis, mais elle vient s’ajouter à un fardeau cumulé déjà considérable.

Depuis le début de l’épidémie actuelle en février 2022, plus de 208 millions de volailles domestiques ont été touchées à l’échelle nationale, selon les chiffres de l’USDA cités par les autorités de l’Iowa. À lui seul, l’Iowa a enregistré plus de 30 millions de volailles touchées au cours de cette période.

L’APHIS recommande de réduire les contacts entre la volaille et les oiseaux sauvages, de protéger les sources d’alimentation et d’eau, de contrôler les déplacements entre les poulaillers et de renforcer les procédures de nettoyage et de désinfection.

L’automne 2026 s’ouvre sur un schéma familier

La période de dix jours la plus récente n’indique pas encore un retour aux pertes massives de volailles observées lors des vagues épidémiques précédentes. Elle montre plutôt la réapparition du virus H5N1 chez les volailles domestiques à mesure que la migration automnale s’intensifie, faisant suite aux foyers détectés dans des élevages commerciaux de dindes dans les États du nord au début du mois de septembre et à la nouvelle détection dans un élevage de basse-cour en Iowa.

Les prochaines semaines seront particulièrement révélatrices. La stratégie de surveillance de l’USDA se concentre sur les 30 derniers jours, car l’activité de l’IAHP peut évoluer rapidement en fonction des déplacements des oiseaux sauvages.

Pour les éleveurs de volailles américains, la tendance observée en septembre marque donc le début d’une nouvelle période saisonnière à haut risque plutôt qu’une nouvelle phase épidémiologique : le virus H5N1 reste présent chez les oiseaux sauvages et continue de se propager à la fois vers les élevages commerciaux et les élevages de basse-cour dès que les conditions écologiques et de biosécurité le permettent.